Die baptisten.wannsee sind Mitglied im Bund Evangelisch-Freikirchlicher Gemeinden in Deutschland K.d.ö.R. (BEFG). Dies ist der Zusammenschluss von ca. 830 Baptisten- und Brüdergemeinden, dem etwa. 83.000 getaufte Mitglieder und viele Kinder und Freunde angehören. Die Bundesgeschäftsstelle des BEFG befindet sich in Elstal (Havelland). Dort ist mit dem Theologischen Seminar (FH) und dem Institut für Mitarbeiter und Gemeindeentwicklung auch die Aus- und Weiterbildung von Haupt- und Ehrenamtlichen beheimatet. EBM international verantwortet die außenmissionarischen Aktivitäten des BEFG.

Regional eingebunden sind wir in den Landesverband Berlin-Brandenburg. Der Landesverband verantwortet die Kinder- und Jugendarbeit in unserer Region (Gemeindejugendwerk), bietet Fortbildungen für Haupt- und Ehrenamtliche an und fördert die Verbundenheit seiner Mitgliedsgemeinden.